環境科學與工程學院的辦學歷史可追溯到20世紀70年代，1984年教育部批準成立海洋環境保護研究中心，1990年在國內率先設立環境海洋學博士點，2000年獲批我國第一批環境科學與工程博士學位授權一級學科，同年設立環境科學與工程博士后流動站，2001年環境科學與工程學院正式成立。

　　學院設有環境科學系和環境工程系，現有教職工82位，已形成院士領銜，筑峰人才、杰青教授為學術帶頭人的教學科研隊伍。學院具有從本科到博士完整的人才培養體系，環境科學學科為國家級重點學科，環境工程專業為國家級特色專業，環境科學與工程實驗教學中心為國家級實驗教學示范中心，學院現有博士生199名，碩士生316名，本科生407名。

　　學院在國內最早開展海洋環境研究，重點關注人類活動與全球變化背景下海洋環境、濱海濕地、大氣環境、地質環境等相關問題的演變過程、機制與工程治理技術。在海洋污染物輸運、海-氣物質交換及其對海洋生態系統的影響、海洋污染物的環境過程和生物響應機制、水下三角洲地質環境監測與成災機理等方面處于國內領先、國際先進地位。

　　學院將緊密圍繞“海洋強國”建設的戰略需求，強化團隊建設，密切國際合作，力爭在未來10-15年，在海洋生態系統演變機制、海洋污染物環境過程、海洋地質環境監測與災害防控工程等方面達到國際一流水平，培養出若干海洋環境領域的領軍人才，將學院全面建設成為海洋環境與生態領域多學科交叉研究、高層次人才培養的國際一流平臺。