根據(jù)我國的有關(guān)規(guī)定，普通碩士教育以培養(yǎng)教學(xué)和科研人才為主，授予學(xué)位的類型主要是學(xué)術(shù)型學(xué)位；而專業(yè)碩士是具有職業(yè)背景的碩士學(xué)位，為培養(yǎng)特定職業(yè)高層次專門人才而設(shè)置。

　　招生條件不同

　　專業(yè)碩士要求報(bào)考者有一定年限的工作經(jīng)歷，而普通碩士則不需要。絕大多數(shù)專業(yè)碩士還要求在職人員報(bào)考需經(jīng)所在單位或相應(yīng)管理部門的同意，有的甚至要求所在單位推薦等。

　　招生考試不同

　　對學(xué)生來說，普通碩士的招生考試只有年初的“統(tǒng)考”，而統(tǒng)考以外的專業(yè)考試則由各招生單位自行命題、閱卷。專業(yè)碩士的招生考試有10月份的“聯(lián)考”和年初的“統(tǒng)考”兩次機(jī)會，考生可以自行選擇，而這兩大國家級別的考試的專業(yè)考試，也由各招生單位自行命題、閱卷。

　　入學(xué)難度不同

全國碩士研究生入學(xué)統(tǒng)一考試（統(tǒng)考）完全是嚴(yán)進(jìn)寬出的代表。據(jù)統(tǒng)計(jì)，2005年研究生考試考生人數(shù)為117萬，招生人數(shù)只有32萬，錄取比例為3.7:1。北大、清華、復(fù)旦等名牌大學(xué)，以及微電子、信息科學(xué)、生物醫(yī)藥、世界經(jīng)濟(jì)、國際金融等熱門專業(yè)，由于報(bào)考者眾多，錄取率更低。據(jù)了解，一些名校熱門專業(yè)的錄取比例甚至為70：1。而一些二流學(xué)校的冷門專業(yè)卻年年招不滿。因此，入學(xué)難度取決于考生報(bào)考的學(xué)校和專業(yè)。

　　專業(yè)碩士的招生考試有10月份的“聯(lián)考”和年初的“統(tǒng)考”兩次機(jī)會，考生可自行選擇。這兩大國家級別考試的專業(yè)考試，是由各招生單位自行命題、閱卷。不同專業(yè)的入學(xué)難度各不相同，熱門專業(yè)相對難一些。例如，2004年上海復(fù)旦、交大、財(cái)大三所高校MBA的錄取比例在6：1左右；2004年全國法律碩士錄取率則不到10％。此外，“聯(lián)考”和“統(tǒng)考”的難度也不一樣，由于“統(tǒng)考”考生遠(yuǎn)多于“聯(lián)考”考生，考試競爭激烈程度自然也大。不過，“聯(lián)考”的考試雖容易，但錄取時(shí)更看重申請者的工作背景和經(jīng)驗(yàn)。

　　學(xué)習(xí)方式不同

　　普通碩士： 全日制學(xué)習(xí)。一般為3年。

　　專業(yè)碩士： 半脫產(chǎn)，學(xué)制2－3年。

　　學(xué)習(xí)費(fèi)用不同

　　普通碩士錄取為國家計(jì)劃內(nèi)（非定向、定向）的碩士 生按國家規(guī)定享受免學(xué)費(fèi)待遇。錄取為國家計(jì)劃外（委托培養(yǎng)、自籌經(jīng)費(fèi)）的碩士 生須繳納學(xué)費(fèi)，一般為8000元/年，不同專業(yè)有所不同。對于自籌經(jīng)費(fèi)生、特困生等考生可通過申請國家助學(xué)貸款或者商業(yè)貸款緩解學(xué)費(fèi)的壓力。

　　 專業(yè)碩士學(xué)費(fèi)按照不同專業(yè)類別差別較大。例如，MBA的學(xué)費(fèi)要十幾甚至幾十萬元，而工程碩士的學(xué)費(fèi)一般為3－4萬元。專業(yè)碩士學(xué)位一般不能申請國家助學(xué)貸款。

　　文憑頒發(fā)不同

　　與普通碩士不同，大多數(shù)專業(yè)碩士只授予學(xué)位證書，沒有學(xué)歷證書。但也有例外，例如工商管理碩士、法律碩士、臨床醫(yī)學(xué)碩士、建筑學(xué)碩士等，就同時(shí)頒發(fā)學(xué)位和學(xué)歷證書。大體來看，“統(tǒng)考”生拿“雙證”，“聯(lián)考”生拿“單證”。